More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00130 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND00130  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase, putative  100 
 
 		 764 aa  1587    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0303135  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37206  predicted protein  39.69 
 
 		 698 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.55659  normal  0.224947 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00757  methyltransferase (Ncl1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14180)  44.75 
 
 		 990 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27152  predicted protein  34.15 
 
 		 700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.652588  normal  0.205318 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36629  predicted protein  34.15 
 
 		 700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.562122  hitchhiker  0.00135175 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31007  predicted protein  34.3 
 
 		 655 aa  326  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.906185  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19070  predicted protein  35.23 
 
 		 555 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48154  predicted protein  43.57 
 
 		 840 aa  194  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48416  predicted protein  32.78 
 
 		 511 aa  187  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.697284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  28.46 
 
 		 302 aa  147  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.97 
 
 		 474 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.77 
 
 		 314 aa  138  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.18 
 
 		 302 aa  138  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.89 
 
 		 302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.69 
 
 		 302 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16406  predicted protein  40 
 
 		 265 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220148  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  31.91 
 
 		 695 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.26 
 
 		 456 aa  118  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.48 
 
 		 499 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  40.68 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.46 
 
 		 485 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  39.2 
 
 		 486 aa  114  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.89 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.29 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  30.57 
 
 		 625 aa  112  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.87 
 
 		 455 aa  111  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  34.07 
 
 		 460 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.57 
 
 		 474 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  40.11 
 
 		 478 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  39.31 
 
 		 467 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  35.32 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.97 
 
 		 471 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.07 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  36.11 
 
 		 436 aa  107  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  36.99 
 
 		 478 aa  107  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 510 aa  107  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  35.38 
 
 		 479 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.38 
 
 		 481 aa  106  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.38 
 
 		 481 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  35.38 
 
 		 479 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 480 aa  106  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.38 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.42 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2455  Fmu (Sun) domain protein  33.49 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.38 
 
 		 481 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  34.55 
 
 		 436 aa  105  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.68 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.16 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.52 
 
 		 505 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.71 
 
 		 339 aa  104  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.42 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.39 
 
 		 505 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  31.08 
 
 		 479 aa  104  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.25 
 
 		 503 aa  104  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.38 
 
 		 479 aa  104  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.52 
 
 		 505 aa  104  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.21 
 
 		 301 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.84 
 
 		 481 aa  104  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.84 
 
 		 481 aa  104  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.02 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.52 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.98 
 
 		 462 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  34.47 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.36 
 
 		 454 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.01 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.52 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.69 
 
 		 455 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  33.65 
 
 		 481 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.64 
 
 		 457 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  35.85 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.44 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  35.59 
 
 		 430 aa  102  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.95 
 
 		 406 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 513 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  35.75 
 
 		 444 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.39 
 
 		 503 aa  102  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 513 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  36.41 
 
 		 447 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2749  NOL1/NOP2/sun family protein  27.48 
 
 		 319 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  37.16 
 
 		 444 aa  101  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  35.27 
 
 		 444 aa  101  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  35.27 
 
 		 444 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 479 aa  101  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  34.36 
 
 		 444 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.3 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  35.75 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  35.75 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 513 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.32 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  35.75 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.99 
 
 		 479 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  35.75 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.91 
 
 		 455 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.48 
 
 		 451 aa  99.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  38.37 
 
 		 481 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.24 
 
 		 482 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  34.16 
 
 		 528 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.57 
 
 		 444 aa  98.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  32.27 
 
 		 416 aa  98.2  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>