More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0554 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  96.41 
 
 
362 aa  716    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  740    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  98.33 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70.39 
 
 
317 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  52.96 
 
 
346 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  54.18 
 
 
331 aa  355  5e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  53.62 
 
 
314 aa  342  8e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  55.44 
 
 
316 aa  330  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  55.96 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  43.79 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  36.93 
 
 
333 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  34.31 
 
 
333 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 
351 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.94 
 
 
414 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 
362 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  32.48 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.07 
 
 
337 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.92 
 
 
370 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.97 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 
358 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 
442 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.79 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  35.71 
 
 
343 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  37.64 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.15 
 
 
344 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 
599 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 
363 aa  109  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 
335 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  25.64 
 
 
327 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  26.5 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 
339 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 
335 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 
415 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 
391 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  38.42 
 
 
339 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  30.04 
 
 
323 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 
425 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 
392 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  31.74 
 
 
335 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 
320 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
338 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  31.93 
 
 
336 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  33.65 
 
 
393 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 
392 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  34.54 
 
 
377 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.21 
 
 
336 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 
336 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 
336 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 
392 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 
314 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 
467 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  36.72 
 
 
416 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 
335 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  27.46 
 
 
357 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 
336 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 
336 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 
339 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 
333 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 
620 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 
467 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.8 
 
 
464 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  35.75 
 
 
407 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
422 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  27.93 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 
333 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.85 
 
 
332 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  27.17 
 
 
331 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.34 
 
 
332 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 
579 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
418 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  28.31 
 
 
330 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  32.99 
 
 
454 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 
406 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
345 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
345 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 
400 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
345 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 
387 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  30.83 
 
 
345 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  33.51 
 
 
384 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  34.48 
 
 
406 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  28.9 
 
 
349 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  30.83 
 
 
333 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
345 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 
421 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  32.39 
 
 
341 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  28.13 
 
 
379 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 
456 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>