242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2095 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  50.83 
 
 		 191 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  39.46 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  39.04 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  41.08 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  40.98 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  39.57 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.98 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  39.23 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  38.38 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  38.1 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  38.1 
 
 		 201 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  37.91 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  38.73 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  42.48 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  37.91 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  38.73 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  38.73 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  36.76 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  37.57 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.51 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  36.31 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.57 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.57 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  37.57 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  35.98 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  34.25 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.87 
 
 		 205 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  34.05 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  34.04 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.29 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  33.52 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  36.36 
 
 		 197 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  33.33 
 
 		 195 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  33.52 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  33.71 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  36.16 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  36.47 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.86 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  38.6 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.46 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  34.76 
 
 		 315 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  31.72 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  32.43 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  32.42 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  35.67 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  36.47 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  36.47 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  33.88 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  34.73 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  36.22 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  32.28 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  33.91 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  33.14 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.36 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  33.51 
 
 		 212 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  35.79 
 
 		 200 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  31.18 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  36.78 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  29.1 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  33.33 
 
 		 321 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  34.05 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.76 
 
 		 321 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.78 
 
 		 330 aa  88.2  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  31.87 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  32.28 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  31.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  31.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  31.72 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  30.59 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  29.07 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  28.42 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  30.68 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.59 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.46 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  28.11 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.38 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  29.84 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.55 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.52 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.77 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.24 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.12 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  26.84 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  40.98 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  42.86 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25.79 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.64 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  46.81 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  25.99 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>