More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1168 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  78.17 
 
 		 197 aa  323  8.000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  75.63 
 
 		 198 aa  313  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  75.63 
 
 		 198 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  74.75 
 
 		 198 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  71.29 
 
 		 204 aa  299  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  60.78 
 
 		 201 aa  257  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  64.04 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  56.91 
 
 		 229 aa  207  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  35.43 
 
 		 189 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  36.52 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  39.22 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  38.67 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  31.41 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  39.61 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  31.98 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  34.39 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  38.56 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.95 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  35.67 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  36.5 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.99 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  30.54 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  30.54 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  30.54 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  29.28 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  30.26 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  27.57 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  31.72 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  29.86 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  32.31 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  32.31 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  26.97 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  30.99 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  30.99 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.08 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  27.15 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  27.15 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  27.15 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  27.15 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  29.08 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  29.05 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  29.05 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  29.05 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  32 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  29.08 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  27.78 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  26.06 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  30.07 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  27.56 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  27.74 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.32 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  25.32 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  24.68 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  24.68 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.23 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.11 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  23.78 
 
 		 521 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  24.29 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  28.66 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  26.04 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.73 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.39 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  23.63 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.63 
 
 		 668 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.69 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.6 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.84 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  28.75 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  25.41 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  28.57 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  28.32 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.93 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  25.44 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  25.61 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  25 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.71 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>