More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0667 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0667  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  71.76 
 
 		 217 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0447  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1305  ABC transporter-related protein  47.17 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000307697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  44.29 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2015  heme exporter protein CcmA  36.32 
 
 		 289 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.71 
 
 		 315 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  34.58 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.86 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.31 
 
 		 305 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  34.11 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.46 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  36.99 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  30.77 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  35.62 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  34.11 
 
 		 306 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  32.09 
 
 		 323 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.55 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  35.62 
 
 		 320 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  34.58 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  31.16 
 
 		 317 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.96 
 
 		 323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  32.56 
 
 		 297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.49 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  31.9 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  34.4 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  31.48 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  30.14 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.48 
 
 		 308 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 252 aa  111  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  32.55 
 
 		 329 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.41 
 
 		 308 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.8 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.68 
 
 		 496 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.02 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  31.34 
 
 		 331 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  32.55 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  32.89 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  32.71 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0857  ABC transporter related  35.89 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 282 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  32.71 
 
 		 306 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3278  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.58 
 
 		 579 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  30.91 
 
 		 360 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  32.08 
 
 		 295 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  32.44 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  31.1 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 		 498 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 501 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  27.98 
 
 		 316 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  33.8 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  30 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  28.04 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.86 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  31.88 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  30.1 
 
 		 336 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  35.65 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 317 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.95 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  31.48 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  31.42 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  32.71 
 
 		 308 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  31.86 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  33.18 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  31.13 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  30.09 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  32.11 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  32.55 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  29.25 
 
 		 307 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  32.38 
 
 		 328 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  32.42 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  32.24 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  28.24 
 
 		 329 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  30.53 
 
 		 309 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  36.87 
 
 		 503 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 293 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 300 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 316 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  31.63 
 
 		 318 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  30.09 
 
 		 302 aa  105  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 315 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 293 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  31.53 
 
 		 283 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>