More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2675 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  91.45 
 
 
433 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  92.38 
 
 
433 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  95.38 
 
 
433 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  100 
 
 
433 aa  876    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  92.61 
 
 
433 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  92.15 
 
 
433 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  74.47 
 
 
434 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  92.84 
 
 
433 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  92.15 
 
 
433 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  70.74 
 
 
451 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  66.2 
 
 
446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  66.51 
 
 
452 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  63.27 
 
 
436 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  63.62 
 
 
433 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  62.8 
 
 
432 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  62.21 
 
 
428 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  54.61 
 
 
445 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  53.38 
 
 
452 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  83.94 
 
 
329 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 
438 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.97 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.03 
 
 
440 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.77 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.75 
 
 
439 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.01 
 
 
437 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  34.71 
 
 
445 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  35.23 
 
 
465 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  34.57 
 
 
425 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 
430 aa  225  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  34.53 
 
 
434 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 
479 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  34.95 
 
 
448 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 
434 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.72 
 
 
462 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.18 
 
 
397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
468 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 
454 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.46 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 
453 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.87 
 
 
436 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.19 
 
 
454 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.3 
 
 
441 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  35.4 
 
 
474 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  33.98 
 
 
435 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.89 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  34.43 
 
 
440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.89 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.2 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.66 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.41 
 
 
409 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  32.65 
 
 
426 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 
461 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  32.65 
 
 
426 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  33.17 
 
 
432 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  34.24 
 
 
445 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  32.3 
 
 
438 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 
452 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  34.14 
 
 
443 aa  209  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
451 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  33.83 
 
 
427 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 
440 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 
447 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  31.26 
 
 
970 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 
448 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.26 
 
 
439 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  31.12 
 
 
427 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  31.12 
 
 
427 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  32.2 
 
 
430 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  30.21 
 
 
426 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  30.89 
 
 
427 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.81 
 
 
411 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  34.22 
 
 
445 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  32.62 
 
 
464 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.02 
 
 
411 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 
410 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  33.26 
 
 
402 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  30.18 
 
 
426 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 
428 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 
434 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  31.97 
 
 
461 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2923  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.49 
 
 
411 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.689777  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  31.62 
 
 
448 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  35.35 
 
 
540 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>