219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1933 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1933  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00663582  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  75.97 
 
 		 310 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  67.44 
 
 		 310 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  72.09 
 
 		 310 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  72.09 
 
 		 310 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  63.28 
 
 		 310 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  73.64 
 
 		 310 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  73.64 
 
 		 310 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  73.64 
 
 		 310 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  73.64 
 
 		 310 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  70.87 
 
 		 310 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  72.87 
 
 		 310 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  75.61 
 
 		 311 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  70.97 
 
 		 334 aa  169  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  68 
 
 		 307 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  70.16 
 
 		 308 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  60.63 
 
 		 310 aa  166  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  71.88 
 
 		 310 aa  166  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  71.32 
 
 		 310 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  68.55 
 
 		 314 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  68.99 
 
 		 310 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  72.13 
 
 		 311 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  66.67 
 
 		 310 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  59.52 
 
 		 312 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  64.06 
 
 		 310 aa  158  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  66.67 
 
 		 309 aa  156  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  62.99 
 
 		 310 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  69.77 
 
 		 310 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  70.73 
 
 		 309 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  66.94 
 
 		 309 aa  153  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  69.92 
 
 		 309 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  61.9 
 
 		 321 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  60.83 
 
 		 310 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  59.84 
 
 		 310 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  60.16 
 
 		 315 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  59.06 
 
 		 312 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  55.56 
 
 		 309 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  58.73 
 
 		 311 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  61.79 
 
 		 309 aa  133  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  57.94 
 
 		 309 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  60.33 
 
 		 309 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  56.67 
 
 		 310 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  58.2 
 
 		 308 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  60.83 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5538  hypothetical protein  57.48 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  59.17 
 
 		 306 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  56.91 
 
 		 310 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  59.17 
 
 		 313 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  59.32 
 
 		 311 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  48 
 
 		 326 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  48.8 
 
 		 310 aa  110  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  48.8 
 
 		 310 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  47.41 
 
 		 305 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  48.25 
 
 		 273 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  52.59 
 
 		 272 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  51.3 
 
 		 272 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  51.3 
 
 		 272 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  50.43 
 
 		 272 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  44.07 
 
 		 289 aa  97.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  42.98 
 
 		 287 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  44.83 
 
 		 275 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  44.35 
 
 		 273 aa  91.3  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  42.62 
 
 		 321 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  40.3 
 
 		 297 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  40.6 
 
 		 293 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  39.39 
 
 		 292 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  43.9 
 
 		 308 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  35.82 
 
 		 297 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  38.85 
 
 		 301 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  37.12 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  43.48 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  42.24 
 
 		 273 aa  80.9  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  34.59 
 
 		 298 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  37.8 
 
 		 296 aa  80.5  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  37.12 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  37.12 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  37.12 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  40.35 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  36.15 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.71 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  36.21 
 
 		 449 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  40.17 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.17 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  35.2 
 
 		 280 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  36.89 
 
 		 293 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  43.75 
 
 		 281 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  38.64 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6127  hypothetical protein  31.25 
 
 		 281 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  34.4 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  38.52 
 
 		 300 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  42.24 
 
 		 271 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  39.32 
 
 		 453 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  41.35 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  37.68 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>