252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3187 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  95.65 
 
 
368 aa  735    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
368 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  85.11 
 
 
368 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  79.56 
 
 
368 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  77.68 
 
 
362 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  78.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  77.4 
 
 
362 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  78.2 
 
 
368 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  77.68 
 
 
358 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  75.14 
 
 
358 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  75.57 
 
 
358 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  70.83 
 
 
361 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  74.02 
 
 
361 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  73.74 
 
 
361 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  70.31 
 
 
361 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  68.13 
 
 
368 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  67.04 
 
 
361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  68.72 
 
 
363 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  67.6 
 
 
362 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  68.82 
 
 
363 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  66.94 
 
 
363 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  56.03 
 
 
354 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  58.17 
 
 
352 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  60.18 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  59.58 
 
 
346 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  56.13 
 
 
353 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  55.4 
 
 
353 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  56.16 
 
 
352 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  55.17 
 
 
358 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  55.59 
 
 
391 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  54.06 
 
 
364 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  55.26 
 
 
345 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  55.01 
 
 
352 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  56.86 
 
 
355 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  55.97 
 
 
337 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  53.01 
 
 
353 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  55.62 
 
 
359 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  53.58 
 
 
388 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  55.69 
 
 
353 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 
344 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  55.86 
 
 
343 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  56.46 
 
 
343 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  56.46 
 
 
343 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  56.46 
 
 
343 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  54.05 
 
 
354 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 
343 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  55.56 
 
 
357 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  54.93 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  52.4 
 
 
344 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  50.59 
 
 
352 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  52.87 
 
 
343 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  53.31 
 
 
342 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  51.03 
 
 
348 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  49.72 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  52.84 
 
 
343 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  50.29 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 
352 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 
353 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  51.32 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
336 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  45.15 
 
 
358 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  37.89 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46.08 
 
 
337 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
382 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  37.12 
 
 
401 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 
359 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  40.24 
 
 
353 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40103  predicted protein  44.87 
 
 
264 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  37.62 
 
 
349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.19 
 
 
339 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
344 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 
339 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  41.5 
 
 
338 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  41.5 
 
 
338 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  41.5 
 
 
338 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 
354 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 
338 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  38.23 
 
 
357 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13793  acyl-CoA dehydrogenase fadE36  39.81 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  36.72 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 
356 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  35.92 
 
 
339 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 
355 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
355 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 
355 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 
349 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
355 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
348 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
355 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>