More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5109 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 330 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57.62 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  44.07 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  40.72 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5892  LacI family transcription regulator  41.69 
 
 		 335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.28 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.09 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.96 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.41 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.17 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.63 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.55 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7655  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.02 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0307  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0353911  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  32.48 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.32 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.72 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.85 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.21 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.83 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.61 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0612  LacI family transcription regulator  31.72 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2465  HTH-type transcriptional regulator, LacI-family  29.82 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.87 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.42 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.12 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.25 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.83 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.21 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.33 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.83 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04812  hypothetical protein  29.39 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2612  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00297504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.82 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0812  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171283  normal  0.194495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.76 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.02 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 340 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.74 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.83 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02556  hypothetical protein  31.44 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1424  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000379312  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>