200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0663 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.74 
 
 
490 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  86.68 
 
 
499 aa  878    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  100 
 
 
493 aa  1012    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.26 
 
 
493 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.21 
 
 
493 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.92 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  50.31 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.31 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.31 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50 
 
 
493 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.62 
 
 
493 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  47.57 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.54 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  48.87 
 
 
504 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.15 
 
 
491 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.89 
 
 
493 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.89 
 
 
493 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.59 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.59 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.59 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.59 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.04 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.82 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.04 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.04 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  47.86 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  50.73 
 
 
494 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.35 
 
 
499 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.96 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  47.05 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.02 
 
 
487 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  46.83 
 
 
480 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.08 
 
 
494 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.08 
 
 
494 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.64 
 
 
486 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.14 
 
 
484 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  47.75 
 
 
490 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  47.36 
 
 
493 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.01 
 
 
479 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.59 
 
 
494 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.53 
 
 
491 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.37 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.04 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.34 
 
 
478 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.84 
 
 
478 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.54 
 
 
478 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.54 
 
 
478 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  46.33 
 
 
486 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.16 
 
 
533 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.18 
 
 
534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  34.23 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.6 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.25 
 
 
532 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.56 
 
 
534 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.56 
 
 
530 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.48 
 
 
516 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.78 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.46 
 
 
534 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.96 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.38 
 
 
529 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.22 
 
 
487 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.95 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.12 
 
 
545 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.89 
 
 
1076 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.27 
 
 
522 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.91 
 
 
848 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.75 
 
 
529 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.95 
 
 
532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.64 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.63 
 
 
533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.01 
 
 
565 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.68 
 
 
651 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.8 
 
 
499 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.54 
 
 
557 aa  202  8e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.01 
 
 
507 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.64 
 
 
531 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  31.41 
 
 
528 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  31 
 
 
539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.52 
 
 
534 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  29.44 
 
 
523 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.11 
 
 
546 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.08 
 
 
527 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  30.79 
 
 
456 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  35.86 
 
 
558 aa  171  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.35 
 
 
620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.47 
 
 
558 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  30 
 
 
588 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  28.81 
 
 
481 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.23 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  30.56 
 
 
589 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  29.15 
 
 
556 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  34.73 
 
 
580 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  26.11 
 
 
560 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  32.16 
 
 
586 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  23.47 
 
 
601 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  31.98 
 
 
560 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  31.66 
 
 
587 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  29.08 
 
 
570 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  31.82 
 
 
582 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  28.37 
 
 
589 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>