133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7234 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  89.93 
 
 		 408 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  67.68 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  67.25 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  59.01 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  52.73 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  54.37 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  57.22 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  34.94 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  25.21 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  27.03 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  28.53 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  25.14 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.46 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.46 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  27.33 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  27.33 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.91 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  30.09 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  23.42 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  29.75 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  28.95 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27.95 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.95 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27.95 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  23.88 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  27.96 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  26.91 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  29.56 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  29.06 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  31.55 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  28.57 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  31.87 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  29.89 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  28 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  23.32 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  26.43 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  26.01 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  31.65 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  29.72 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  27.85 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  26.03 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  30.27 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  27.65 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  30.59 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  30.06 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  27.15 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  28.66 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  29.44 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  27.75 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  27.65 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  26.23 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  26.94 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  27.31 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  23.58 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  28.99 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  29.96 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  24 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  25 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  21.35 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  28.78 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  27.54 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>