More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6305 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  90.77 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  76.83 
 
 		 255 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  76.21 
 
 		 258 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  75 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  75 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  75 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  75 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  74.6 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  73.79 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  73.79 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  73.79 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  74.19 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  71.77 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  71.26 
 
 		 252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  59.92 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  58.13 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  59.5 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  56.69 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  59.2 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  56.28 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  58.7 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  59.06 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  55.69 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  54.84 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  58.4 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  59.41 
 
 		 246 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.85 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  53.15 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  54.51 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.85 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  51.56 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  54.78 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  57.33 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.9 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  51.81 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  51.81 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 269 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  53.42 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  51.41 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  46.06 
 
 		 572 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 571 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  45.49 
 
 		 566 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  45.49 
 
 		 571 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 571 aa  207  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  45.88 
 
 		 545 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 		 341 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.570854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  43.73 
 
 		 545 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  43.35 
 
 		 545 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 		 348 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  44.35 
 
 		 531 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  48.97 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 543 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 539 aa  205  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  44.4 
 
 		 541 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1715  ABC transporter related  45.1 
 
 		 535 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  50.87 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  50.87 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  45.1 
 
 		 535 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  46.64 
 
 		 537 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  40.84 
 
 		 530 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 545 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.41 
 
 		 534 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.23 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.92 
 
 		 564 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  44.53 
 
 		 543 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  40.7 
 
 		 547 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 539 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 587 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  43.9 
 
 		 545 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  44.11 
 
 		 543 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 544 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4150  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 534 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  44.19 
 
 		 539 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 340 aa  201  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 340 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 549 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  45.42 
 
 		 566 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 563 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 549 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 536 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>