More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6155 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  65.9 
 
 		 564 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6155  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 559 aa  1129    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6576  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.96 
 
 		 583 aa  886    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1504  putative choline dehydrogenase  90.68 
 
 		 591 aa  1023    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228546  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1311  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.91 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6668  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.14 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4787  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.7 
 
 		 573 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.824401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4733  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.37 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4242  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.01 
 
 		 549 aa  359  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.02 
 
 		 554 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.87 
 
 		 515 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  33.45 
 
 		 560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  33.67 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1592  choline dehydrogenase  34.18 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.860333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  33.39 
 
 		 568 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  33.33 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  33.28 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  33.28 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  33.84 
 
 		 565 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  35.14 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4716  choline dehydrogenase  34.75 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.959774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  33.22 
 
 		 568 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  31.46 
 
 		 560 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  33.84 
 
 		 561 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  33.62 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  33.62 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  33.67 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  33.5 
 
 		 565 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.8 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  33.5 
 
 		 566 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  33.67 
 
 		 565 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  33.16 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  33.5 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  33.16 
 
 		 566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  33.5 
 
 		 561 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  31.76 
 
 		 556 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.19 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  32.99 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  33.79 
 
 		 565 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  33.5 
 
 		 566 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  31.59 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  32.83 
 
 		 565 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  31.59 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  34.46 
 
 		 552 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.36 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  33.73 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  33.73 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  33.73 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  33.73 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  31.59 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  31.59 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  33.05 
 
 		 563 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.82 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  31.63 
 
 		 559 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  31.42 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.26 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  32.77 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.48 
 
 		 543 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0914  choline dehydrogenase  33.56 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0468  choline dehydrogenase  33.56 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  33.56 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1428  choline dehydrogenase  33.56 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1739  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.06 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.76 
 
 		 560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.22 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  30.76 
 
 		 556 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.24 
 
 		 541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  33.61 
 
 		 557 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  31.97 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 562 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  31.33 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  31.06 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.1 
 
 		 547 aa  233  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  34.67 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.72 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.74 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  32.72 
 
 		 561 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 552 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 535 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  32.25 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  31.69 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  32.25 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  32.25 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.94 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.59 
 
 		 571 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.49 
 
 		 541 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  32.65 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.16 
 
 		 551 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 531 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  29.85 
 
 		 571 aa  227  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.93 
 
 		 609 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.45 
 
 		 536 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.38 
 
 		 529 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.14 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  33.78 
 
 		 551 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>