More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5604 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  75.95 
 
 		 317 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  53.02 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  47.33 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  47.64 
 
 		 315 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  45.76 
 
 		 316 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  47.3 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  47.3 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  47.3 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  45.51 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  45.51 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  46.15 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  45.67 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  44.48 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  44.48 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  43.35 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  37.5 
 
 		 151 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  37.5 
 
 		 151 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 153 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.86 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  39.16 
 
 		 168 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.55 
 
 		 157 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 159 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  39.16 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.66 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  37.06 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.72 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  34.42 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  41.33 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  37.32 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.62 
 
 		 187 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  37.76 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26.1 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  40.27 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.38 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  35.42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  37.93 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  35.42 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  27.68 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.02 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  40.43 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.64 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.32 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.62 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.02 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.98 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4815  UspA domain protein  38.21 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3738  UspA domain protein  38.21 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  38.51 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.17 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.39 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.1 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.64 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.36 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.64 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.57 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.25 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.25 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.1 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.25 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>