97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1645 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  91.93 
 
 
161 aa  309  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  77.64 
 
 
161 aa  264  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  76.35 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  76.35 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  76.35 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  76.35 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  71.43 
 
 
153 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1757  putative lipoprotein  71.43 
 
 
160 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.980329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1779  putative lipoprotein  71.43 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1929  hypothetical protein  71.43 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  69.57 
 
 
153 aa  223  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  70.19 
 
 
153 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1489  hypothetical protein  79.7 
 
 
153 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  hitchhiker  0.000316489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1513  hypothetical protein  79.7 
 
 
153 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.715574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1033  hypothetical protein  79.7 
 
 
153 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  82.31 
 
 
153 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1395  hypothetical protein  80.47 
 
 
153 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  58.4 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  56 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  58.4 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  56 
 
 
149 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  59.2 
 
 
151 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  58.4 
 
 
151 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  47.65 
 
 
155 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  50.81 
 
 
168 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0418  hypothetical protein  56.8 
 
 
147 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130226  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  49.6 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  44.97 
 
 
148 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  49.21 
 
 
147 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1175  putative signal peptide protein  42.11 
 
 
148 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2649  hypothetical protein  40.76 
 
 
166 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.799269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  46.26 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  50.38 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  50.38 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  43.57 
 
 
202 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4088  hypothetical protein  49.21 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  43.66 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  40.41 
 
 
146 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  43.65 
 
 
144 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  43.65 
 
 
144 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1617  hypothetical protein  39.07 
 
 
154 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000464775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3518  hypothetical protein  45.16 
 
 
144 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.446687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  45.07 
 
 
143 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0566  hypothetical protein  41.86 
 
 
133 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1651  hypothetical protein  35.44 
 
 
218 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3837  hypothetical protein  36.88 
 
 
217 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216849  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  39.17 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4468  hypothetical protein  35.11 
 
 
218 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1465  hypothetical protein  35.83 
 
 
214 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0300883  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  37.69 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0966  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  38.03 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  37.11 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  30.61 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1857  hypothetical protein  29.61 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000332835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2648  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  31.37 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0523  hypothetical protein  32.23 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372875  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  25.34 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.14 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  31.47 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  48.44 
 
 
148 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0038  putative signal peptide protein  28.67 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  28.67 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1090  hypothetical protein  48.98 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177825  normal  0.714021 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0805  hypothetical protein  25.4 
 
 
186 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  26.98 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0576  Protein of unknown function DUF2147  26.12 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  30.67 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2543  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  28.29 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  26.71 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.79 
 
 
129 aa  47.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  26.72 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  25.17 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  28.06 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.17 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  28.08 
 
 
231 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  36.76 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  26.9 
 
 
204 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  25 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  27.1 
 
 
178 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  41.27 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3110  hypothetical protein  32.84 
 
 
78 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>