More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6552 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6095  porin  78.33 
 
 		 405 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  100 
 
 		 406 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  75.07 
 
 		 405 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  75.85 
 
 		 405 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  74.61 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  72.61 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  72.62 
 
 		 406 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  71.92 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  71.61 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  74.28 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  69.25 
 
 		 411 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  68.85 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  68.59 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  68.85 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  68.85 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  68.32 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  61.65 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  65.97 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  61.65 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  64.34 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  61.65 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  64.08 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  65.97 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  61.89 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  46.23 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  46.46 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.98 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  46.23 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  47.71 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  47.44 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.44 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.39 
 
 		 402 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.52 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  41.65 
 
 		 411 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  42.61 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  42.36 
 
 		 397 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.11 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.56 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  42.61 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  42.61 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  42.61 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.36 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  39.65 
 
 		 399 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  39.39 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.29 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  39.61 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  39.36 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  39.36 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.36 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.36 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  39.12 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  36.36 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.36 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.36 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  39.12 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  39.12 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  39.12 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.36 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.12 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.57 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  36.12 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.37 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  39.19 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  37.84 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  37.84 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  39.43 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.48 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  38.83 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.37 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  38.29 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  37.5 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.71 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  38.05 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.47 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  37.71 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.9 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  36.25 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  39.06 
 
 		 385 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  38.52 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  37.47 
 
 		 376 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  38.5 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  38.52 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  38.52 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  38.52 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  37.92 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  37.92 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  38.52 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  38.52 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  38.52 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  36.34 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.34 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  34.5 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  36.52 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  37.44 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  37.14 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  37.14 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>