More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6199 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6199  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 653 aa  1332    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0449269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4646  3-isopropylmalate dehydratase  58.17 
 
 		 655 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715504  normal  0.524073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1455  aconitate hydratase domain protein  57.23 
 
 		 646 aa  763    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0166  aconitate hydratase domain protein  38.89 
 
 		 659 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  33.33 
 
 		 432 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  31.55 
 
 		 432 aa  206  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.46 
 
 		 431 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.62 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.69 
 
 		 434 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.39 
 
 		 418 aa  198  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  32.15 
 
 		 643 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.04 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  31.79 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.83 
 
 		 440 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.92 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  31.1 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  32.59 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  29.98 
 
 		 424 aa  191  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  30.26 
 
 		 435 aa  190  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.01 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  29.89 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  30.75 
 
 		 432 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  34.58 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  31.3 
 
 		 472 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  31.36 
 
 		 431 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  34.76 
 
 		 639 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  30.42 
 
 		 429 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  29.38 
 
 		 471 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  29.89 
 
 		 439 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  31.51 
 
 		 655 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  30.87 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  31.14 
 
 		 419 aa  184  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.18 
 
 		 419 aa  184  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.01 
 
 		 428 aa  183  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  30.69 
 
 		 431 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  31.43 
 
 		 431 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.37 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.28 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  30.46 
 
 		 642 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  31.15 
 
 		 424 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  30.57 
 
 		 416 aa  180  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.35 
 
 		 424 aa  180  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0286  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.68 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2737  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.79 
 
 		 427 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000214153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.53 
 
 		 424 aa  178  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.03 
 
 		 424 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  29.94 
 
 		 481 aa  178  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3742  isopropylmalate isomerase large subunit  27.62 
 
 		 466 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.7 
 
 		 421 aa  177  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.54 
 
 		 429 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  29.05 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.42 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.98 
 
 		 427 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1504  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.57 
 
 		 427 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.691126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  30.43 
 
 		 420 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  29.8 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0285  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.18 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0292162  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  29.76 
 
 		 642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  28.43 
 
 		 468 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0608  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.71 
 
 		 421 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  29.11 
 
 		 481 aa  173  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1268  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.5 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000132862  hitchhiker  0.0000000000181918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  32.97 
 
 		 655 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  28.08 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  32.41 
 
 		 644 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  30.92 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  28.86 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1622  isopropylmalate isomerase large subunit  27.38 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  33.71 
 
 		 642 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  30.92 
 
 		 645 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  30.87 
 
 		 657 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.15 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.71 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03341  isopropylmalate isomerase large subunit  27.38 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.6876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  30 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0275  3-isopropylmalate dehydratase  28.6 
 
 		 415 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.772667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.99 
 
 		 420 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0399  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.17 
 
 		 424 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.320252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  31.04 
 
 		 421 aa  171  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.22 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0471  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.48 
 
 		 424 aa  170  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.699773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1520  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.41 
 
 		 424 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.984893  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.29 
 
 		 417 aa  170  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  28.4 
 
 		 484 aa  170  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1883  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.29 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0015  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.96 
 
 		 418 aa  170  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.22 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.22 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  28.88 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1604  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  29.21 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135102  normal  0.0211413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.82 
 
 		 413 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.96 
 
 		 420 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.71 
 
 		 418 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2142  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.87 
 
 		 419 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.245729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0830  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.49 
 
 		 415 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  29.78 
 
 		 661 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  34.52 
 
 		 668 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  28.02 
 
 		 471 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  28.23 
 
 		 481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  29.14 
 
 		 762 aa  168  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>