108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4554 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  93.12 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  36.44 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.19 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.11 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.26 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  27.46 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.46 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.46 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  27.53 
 
 		 301 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  28.68 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  27.89 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  27.89 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  27.89 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  29.46 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  27.49 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  26.06 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  26.06 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.21 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.77 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  26.95 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.89 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.65 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.65 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.11 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  29.41 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  26.28 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.7 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.64 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  25.2 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  24.75 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  29.59 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  25.57 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  25.57 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.42 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  23.74 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.27 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.4 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.94 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.43 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  24.15 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.23 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  27.97 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.14 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  22.67 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.54 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.95 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.49 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.5 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  24.79 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  26.47 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  22.46 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  22.41 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.67 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.21 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  30 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  27.82 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.37 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  25.97 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.82 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.44 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_7544  predicted protein  34.58 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.42 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  26.03 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3845  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.25 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.59 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48560  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.947349  normal  0.0199481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  24.52 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  22.54 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  33.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>