132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3977 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  75.44 
 
 		 241 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  73.68 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  71.93 
 
 		 241 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  71.61 
 
 		 242 aa  352  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  67.81 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  67.83 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  56.71 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  54.08 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  48.92 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  51.95 
 
 		 243 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  51.28 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  51.28 
 
 		 251 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  48.72 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  50.21 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  50.21 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  50.64 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  48.46 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  44.87 
 
 		 257 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  46.7 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  43.83 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  42.67 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  40.95 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  40.61 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  39.74 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  42.41 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  42.6 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  42.86 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  41.48 
 
 		 277 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  39.19 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  39.48 
 
 		 270 aa  164  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  39.38 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  38.94 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  38.05 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  39.22 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  38.03 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  37.12 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  37.55 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  34.91 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  36.12 
 
 		 280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  34.15 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  31.03 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  31.03 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  35.27 
 
 		 281 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  30.1 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  32.09 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  31.84 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  35.06 
 
 		 287 aa  114  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  34.8 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  36.28 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  32.54 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  32.47 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  36.46 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  36.46 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  30.88 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  31.68 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  30.61 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.7 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32.76 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  30.5 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  32.86 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  35.18 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  31.78 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  35.94 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  32.67 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  33.17 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  30.69 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  34.33 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  34.31 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.34 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  32.65 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  32.5 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  32.04 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  34.41 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  32.5 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  33.88 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  32.52 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  31.03 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  30.69 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  30.39 
 
 		 211 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  30.43 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  32.8 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  30.81 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  28.57 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  30.05 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  29.35 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  30.32 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  28.86 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  31.33 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  28.34 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>