More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0400 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0400  porin  100 
 
 		 375 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  80.39 
 
 		 373 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  78.71 
 
 		 373 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  42.21 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.16 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  27.8 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30.33 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  33.68 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  30.45 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  30.95 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  30.69 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  31.51 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  30.2 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  31.94 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  30.57 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  31.35 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  31.35 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.82 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  30.3 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.96 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.99 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  28.96 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  25.87 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  25.87 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  25.87 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  30.95 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  29.74 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.62 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.02 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.59 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  26.46 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.59 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  26.2 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  26.2 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  29.61 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  26.2 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.55 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.55 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.55 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  26.39 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  31.53 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  26.43 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  26.05 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  26.05 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  26.05 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  26.05 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  26.05 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  26.05 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.53 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  32.42 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  30.53 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  29.87 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  32.38 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  29.75 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5535  porin Gram-negative type  28.46 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.438233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  28.39 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  28.35 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  29.03 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  31.03 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.09 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  31.66 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  31.66 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  31.66 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.13 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  32.45 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  31.41 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  32.45 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  29.67 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  31.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  31.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  31.41 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  32.45 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  29.97 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  30.25 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.04 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  27.76 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  28.9 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.11 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.11 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.53 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  28.64 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  30.36 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4041  porin Gram-negative type  29.62 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  30.46 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  30.45 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.8 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  29.17 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  30.28 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  28.13 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  32.12 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  31.07 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  28.13 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  26.11 
 
 		 357 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  30.43 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  30.46 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.43 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  30.29 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  30.29 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  30.13 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>