More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0635 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.44 
 
 		 712 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.32 
 
 		 742 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.554464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.01 
 
 		 705 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0369  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.88 
 
 		 717 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.27 
 
 		 697 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.4 
 
 		 696 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.2 
 
 		 703 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0845346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  51.09 
 
 		 698 aa  676    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000243364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.92 
 
 		 701 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.46 
 
 		 728 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3055  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 704 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1334  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.06 
 
 		 698 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.44 
 
 		 712 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.43 
 
 		 705 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.09 
 
 		 709 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1007  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.93 
 
 		 693 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0328519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.26 
 
 		 702 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  678    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2816  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.14 
 
 		 729 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2685  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.01 
 
 		 729 aa  658    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2918  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.83 
 
 		 740 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777239  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.25 
 
 		 696 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3412  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 700 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000844924  hitchhiker  0.000972679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.41 
 
 		 699 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1360  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.06 
 
 		 698 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1259  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.21 
 
 		 758 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0693  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.13 
 
 		 706 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0464736  normal  0.106902 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.42 
 
 		 690 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1258  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.28 
 
 		 733 aa  644    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3556  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.33 
 
 		 702 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.55 
 
 		 695 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 703 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1112  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.39 
 
 		 716 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.48 
 
 		 699 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 712 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.57 
 
 		 712 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.9 
 
 		 696 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2997  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.95 
 
 		 711 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 		 698 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3275  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.2 
 
 		 700 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000261182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1129  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.13 
 
 		 694 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1399  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.35 
 
 		 751 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.82 
 
 		 753 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2553  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.33 
 
 		 701 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.587578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.44 
 
 		 717 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.28 
 
 		 723 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.98 
 
 		 734 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.368343  normal  0.96834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.68 
 
 		 700 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.25 
 
 		 696 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03393  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.72 
 
 		 710 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.84 
 
 		 733 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.04 
 
 		 696 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  47.42 
 
 		 692 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.2 
 
 		 722 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.71 
 
 		 747 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0071  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.39 
 
 		 714 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000128899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3260  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.78 
 
 		 707 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0635  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  100 
 
 		 716 aa  1458    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1019  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.33 
 
 		 701 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000461081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  677    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1133  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 699 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000984141  unclonable  0.0000000000121656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.97 
 
 		 736 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2829  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 699 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000362505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  49.05 
 
 		 815 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1696  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.08 
 
 		 699 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00000649299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0078  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.14 
 
 		 711 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.15 
 
 		 712 aa  678    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3384  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.1 
 
 		 704 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000712799  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.39 
 
 		 716 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.41 
 
 		 703 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.38 
 
 		 715 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.18 
 
 		 700 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000990055  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.84 
 
 		 702 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.44 
 
 		 712 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1745  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.36 
 
 		 702 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.22 
 
 		 699 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000012543  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.22 
 
 		 699 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 698 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0673762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.05 
 
 		 703 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.80141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1442  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  51.02 
 
 		 735 aa  691    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.35 
 
 		 718 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50.58 
 
 		 710 aa  688    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2047  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.88 
 
 		 769 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0512862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0114  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.44 
 
 		 741 aa  659    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.613671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.13 
 
 		 777 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.2 
 
 		 699 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.66 
 
 		 699 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000390234  hitchhiker  0.0000000630128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0968  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.68 
 
 		 706 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0868  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.82 
 
 		 727 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.185625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.36 
 
 		 718 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.25 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.01 
 
 		 706 aa  634  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.6 
 
 		 700 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0178  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.77 
 
 		 712 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0953  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.68 
 
 		 727 aa  635  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.83 
 
 		 720 aa  633  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.06 
 
 		 701 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>