More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  83.68 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  82.07 
 
 		 194 aa  315  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  81.62 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  79.57 
 
 		 199 aa  309  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  77.89 
 
 		 190 aa  309  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  80.54 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  79.23 
 
 		 192 aa  307  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  79.14 
 
 		 190 aa  307  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  76.19 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  76.06 
 
 		 189 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  77.17 
 
 		 191 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.13 
 
 		 187 aa  297  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  79.89 
 
 		 189 aa  296  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  79.78 
 
 		 192 aa  294  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  76.06 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  76.22 
 
 		 198 aa  292  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  76.24 
 
 		 191 aa  290  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  73.89 
 
 		 196 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  73.8 
 
 		 188 aa  287  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  74.86 
 
 		 191 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  72.58 
 
 		 187 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  78.07 
 
 		 189 aa  273  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  78.07 
 
 		 189 aa  273  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  74.21 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  73.66 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  73.66 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  73.66 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  73.84 
 
 		 184 aa  267  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 187 aa  265  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  72.49 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  67.37 
 
 		 190 aa  262  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  72.04 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  73.26 
 
 		 188 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  72.87 
 
 		 189 aa  257  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 187 aa  254  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  65.26 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  76.24 
 
 		 199 aa  250  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.7 
 
 		 186 aa  245  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 193 aa  241  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  241  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  240  7.999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  61.5 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  57.98 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  60.75 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  62.01 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  56.04 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 		 182 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>