More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  100 
 
 
266 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  44.59 
 
 
290 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  42.17 
 
 
304 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  48.77 
 
 
290 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  42.86 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  44.64 
 
 
247 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  48.19 
 
 
251 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  40 
 
 
284 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  43.2 
 
 
267 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  42.18 
 
 
268 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  44.39 
 
 
254 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  38.39 
 
 
291 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  44.32 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  40.47 
 
 
342 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  38.16 
 
 
285 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  40.28 
 
 
469 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  33.97 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  42.23 
 
 
311 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  36.62 
 
 
199 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  38.16 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  36.13 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  40.74 
 
 
289 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  38.02 
 
 
360 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  38.74 
 
 
288 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  40.49 
 
 
313 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  34.31 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  36.09 
 
 
289 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  37.02 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  37.81 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  37.32 
 
 
213 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  35.34 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  37.32 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  38.6 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  36.04 
 
 
298 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  34.06 
 
 
299 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  34.62 
 
 
225 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  37.5 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  38.89 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  38.6 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  38.36 
 
 
304 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  34.44 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  34.44 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  34.44 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  36.22 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  34.05 
 
 
286 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  35.92 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  36.22 
 
 
173 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  33.62 
 
 
272 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.69 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  33.01 
 
 
174 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  35.94 
 
 
288 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.68 
 
 
184 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  35.75 
 
 
434 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  36.73 
 
 
309 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  32.06 
 
 
185 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  34.8 
 
 
352 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.31 
 
 
187 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  32.69 
 
 
230 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  35.68 
 
 
199 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  30.7 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.54 
 
 
192 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.35 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.67 
 
 
214 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.54 
 
 
193 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  27.71 
 
 
186 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  35.81 
 
 
206 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  31.34 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.1 
 
 
171 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.85 
 
 
190 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  35.19 
 
 
200 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.03 
 
 
200 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.03 
 
 
200 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.27 
 
 
198 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  29.77 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  31.58 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.02 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.92 
 
 
220 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  35.35 
 
 
197 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  30.58 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.13 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  31.87 
 
 
192 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.04 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  33.51 
 
 
191 aa  90.1  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  32.05 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  30.71 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.32 
 
 
220 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.37 
 
 
220 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.26 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.86 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  28.85 
 
 
183 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  29.81 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.92 
 
 
221 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.49 
 
 
221 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  29.68 
 
 
183 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  28.37 
 
 
183 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>