296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2555 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 323 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  90.09 
 
 		 323 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  89.78 
 
 		 323 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  88.54 
 
 		 323 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  88.54 
 
 		 323 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  75.24 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  69.06 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  66.56 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  33.85 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  35.28 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  36.96 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  35.2 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  36.48 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  36.3 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.43 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  36.43 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  36.43 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.24 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.43 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.21 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.13 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.72 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  37.04 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.99 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.31 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 		 332 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.17 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  30.11 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.08 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.08 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.27 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.06 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.26 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 353 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.06 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  34.22 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  29.87 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>