More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1486 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1486  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 352 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.193369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4267  AraC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2042  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2047  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 350 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  26.48 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  29.48 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 337 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  30.29 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0381  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0662  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3885  hypothetical protein  87.18 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  25.76 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  26.61 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4692  transcriptional regulator, AraC family  33.51 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  29.89 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  37.17 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1576  AraC family transcription regulator  46.59 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0088  AraC family transcription regulator  46.59 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  32.58 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2858  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0573433  normal  0.104932 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0077  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1236  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1518  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>