115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0664 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0664  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 360 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2686  LuxR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  26.16 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  25.07 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 529 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0181  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 600 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 462 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  23.89 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2824  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 535 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03610  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.166414  normal  0.0491532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.14 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1389  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.544965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 516 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 251 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 251 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 242 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.1 
 
 		 474 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 492 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0167  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 493 aa  46.2  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.165739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  24.61 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.87 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0500  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.472786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0992  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  24.81 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2775  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.257993  normal  0.934511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  46.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  32.26 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2795  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2353  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 516 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  30.49 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 1005 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0171  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0630  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 528 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0529  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 518 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1110  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 245 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.33 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0978  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.159022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 219 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  38.18 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 799 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1062  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 933 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0202732  normal  0.168937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>