More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4755 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4755  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18022  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5360  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.889507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2483  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2562  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4083  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0921  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5351  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2901  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2717  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.624024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1546  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0468693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3521  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.47 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1887  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4622  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0258  transcriptional regulator, LysR family  42.77 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1542  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222997  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48500  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000351287  normal  0.143961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2971  LysR family substrate binding transcriptional regulator  26.35 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3143  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2571  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2369  LysR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 286 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.03 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2712  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3266  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.7 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0106  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4269  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0981  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5212  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5916  LysR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.746301 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5711  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.831574  normal  0.349345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1431  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53118  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6398  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5113  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.7 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.49 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5166  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3201  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0715  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.7 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2153  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4318  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.16 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4485  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5904  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2364  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2089  LysR substrate-binding  39.52 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0073  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3473  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0039  transcriptional regulator TrpI  44.19 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3783  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.00000939543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5412  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.43 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0462  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.33 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0247  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1529  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4869  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0265768  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02110  trpBA operon transcriptional regulator, LysR family; TrpI  42.52 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4612  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3061  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.638597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.77 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6070  transcriptional regulator, LysR family  38.2 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0447  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2722  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3953  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.34 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3048  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5074  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3307  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0381  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>