More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3508 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  95.39 
 
 		 347 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 347 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  97.98 
 
 		 347 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  90.2 
 
 		 346 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  90.2 
 
 		 346 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  86.46 
 
 		 347 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  77.23 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  72.38 
 
 		 343 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  75.71 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  72.09 
 
 		 343 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  75.71 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  76 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  70.89 
 
 		 341 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  72.62 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  64.57 
 
 		 352 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  64.55 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  64.66 
 
 		 348 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  64.47 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  63.98 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.37 
 
 		 350 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  63.4 
 
 		 354 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  62.82 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  63.99 
 
 		 349 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  64.84 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  63.04 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  63.04 
 
 		 350 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  68.15 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  64.06 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  67.43 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  62.76 
 
 		 346 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  61.28 
 
 		 346 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  63.01 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.08 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  60.18 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  55.75 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  56.98 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  60.88 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  56.09 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  56.51 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  54.45 
 
 		 307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  53.04 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.9 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  52.22 
 
 		 296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  49.49 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 		 293 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 		 308 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.7 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.11 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 298 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  36.75 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 310 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 310 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.04 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 296 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 296 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  36.17 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  34.98 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 287 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.32 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>