120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0887 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0887  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.228672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  90.24 
 
 		 581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  84.55 
 
 		 577 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  72.73 
 
 		 570 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  69.09 
 
 		 564 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  62.73 
 
 		 588 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  60 
 
 		 583 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  62.75 
 
 		 572 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  43.3 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  51.09 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  55.13 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  48.72 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  42.34 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  47.5 
 
 		 570 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  51.35 
 
 		 586 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  48.65 
 
 		 555 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  47.44 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  47.44 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  47.44 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 569 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  48.19 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 555 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  43.18 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 541 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 553 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 553 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  38.18 
 
 		 550 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 553 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 553 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  44.93 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  35.71 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  48.24 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 559 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 559 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  48.68 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  42.5 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 535 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  44.62 
 
 		 624 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 563 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  40 
 
 		 540 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  45.31 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 490 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 535 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 546 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 544 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.2 
 
 		 554 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  30.2 
 
 		 554 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40 
 
 		 543 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.17 
 
 		 594 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  30.2 
 
 		 554 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  37.33 
 
 		 547 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 		 493 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.53 
 
 		 554 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  40.26 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  32.97 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  39.06 
 
 		 486 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  41.54 
 
 		 536 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.86 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  32.97 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3304  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  42.42 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0850508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.57 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.19 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 		 486 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0297  monooxygenase FAD-binding protein  30.36 
 
 		 406 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.19 
 
 		 554 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.19 
 
 		 554 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  25.6 
 
 		 407 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  25.44 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  36.76 
 
 		 564 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 		 547 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  39.19 
 
 		 434 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 543 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  36.36 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  41.27 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  34.62 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  39.24 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  34.29 
 
 		 511 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  36.92 
 
 		 557 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.29 
 
 		 555 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  43.08 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  37.66 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 553 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>