More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0758 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  99.65 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  90.28 
 
 
288 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  62.72 
 
 
304 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  58.89 
 
 
316 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.99 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.99 
 
 
315 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  53.5 
 
 
315 aa  328  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  54.9 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.94 
 
 
316 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  55.96 
 
 
291 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  55.59 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  51.59 
 
 
293 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  48.26 
 
 
291 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  50.35 
 
 
337 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  48.26 
 
 
291 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  47.92 
 
 
291 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  50 
 
 
334 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  49.65 
 
 
302 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  47.92 
 
 
291 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  51.37 
 
 
327 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  48.95 
 
 
322 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 
324 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 
324 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  46.38 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  46.53 
 
 
295 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  48.25 
 
 
331 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  47.55 
 
 
324 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.14 
 
 
336 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  50.35 
 
 
328 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  55 
 
 
294 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4731  secretion protein HlyD family protein  56.22 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  48.66 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  45.55 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  46.18 
 
 
294 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 
294 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  50.71 
 
 
311 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  45.8 
 
 
305 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  47.83 
 
 
299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  49.3 
 
 
299 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  44.57 
 
 
297 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  45.16 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  45.1 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 
289 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 
289 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 
284 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 
288 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 
285 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  46.07 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 
287 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  41.96 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 
287 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  45.69 
 
 
302 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 
287 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  41.96 
 
 
286 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  47.62 
 
 
286 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  46.15 
 
 
291 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 
287 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 
286 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 
286 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  42.01 
 
 
300 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 
286 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  46.15 
 
 
291 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  45.62 
 
 
292 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 
289 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.89 
 
 
314 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  45.05 
 
 
292 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  45.05 
 
 
292 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4096  secretion protein HlyD  43.36 
 
 
270 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  42.59 
 
 
287 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  44.76 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 
294 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  40.07 
 
 
286 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  39.72 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  46.15 
 
 
292 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 
344 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  42.96 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  45.42 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3499  secretion protein HlyD family protein  41.97 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  45.42 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  45.42 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  45.42 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  45.79 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  45.42 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  45.42 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  45.42 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  45.42 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  39.35 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  40.54 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 
285 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 
285 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  44.06 
 
 
291 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  38.99 
 
 
285 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
285 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  38.63 
 
 
285 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  38.27 
 
 
285 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  40.07 
 
 
285 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.91 
 
 
285 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>