183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0496 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  99.7 
 
 		 331 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  100 
 
 		 339 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  100 
 
 		 339 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  99.71 
 
 		 339 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  100 
 
 		 339 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  100 
 
 		 339 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  94.67 
 
 		 339 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  83.13 
 
 		 335 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  83.13 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  83.13 
 
 		 378 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  83.28 
 
 		 335 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  83.28 
 
 		 335 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  84.19 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  83.28 
 
 		 334 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  76.44 
 
 		 338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  75.61 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  75.23 
 
 		 338 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  61.35 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  58.9 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  57.85 
 
 		 332 aa  361  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  56.17 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  55.7 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  57.72 
 
 		 326 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  58.18 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  54.49 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  52.76 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  51.23 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  59.41 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  51.2 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  50.89 
 
 		 356 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  51.9 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  49.28 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  52.29 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  52.54 
 
 		 341 aa  288  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  53.52 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  51.8 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  51.8 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  32.49 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  31.11 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  28.53 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  28.53 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.17 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  29.03 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  27.18 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  32.31 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  27.97 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.93 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  28.72 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  25.59 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  26.76 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  33.99 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  29.25 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  28.98 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  26.06 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  27.42 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  27.65 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  27.42 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  27.67 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  30.15 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  25.31 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  23.79 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  27.09 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  28.97 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  27.78 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  29.1 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  25.4 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  27.78 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.03 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  28.57 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  28.28 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  27.78 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  27.27 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  27.7 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  28.82 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.55 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  28.57 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  27.73 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.34 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  30 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  29.34 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  29.21 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  27.43 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  25.82 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  29.82 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  27.2 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  27.98 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  27.91 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  27.1 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  27.72 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  27.35 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  27.24 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  26.48 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  26.44 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  31.22 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>