133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0273 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0273  RNA polymerase sigma-70 factor  100 
 
 
137 aa  277  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5577  RNA polymerase sigma factor  73.33 
 
 
194 aa  209  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.605302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2758  RNA polymerase sigma factor  39.29 
 
 
192 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000734686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2970  RNA polymerase sigma factor  39.29 
 
 
192 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2966  RNA polymerase sigma factor  39.29 
 
 
192 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000101714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2148  RNA polymerase sigma factor  37.62 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1966  RNA polymerase sigma factor  36.63 
 
 
192 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2114  RNA polymerase sigma factor  36.63 
 
 
192 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1945  RNA polymerase sigma factor  39.33 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2124  RNA polymerase sigma factor  37.08 
 
 
192 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1958  RNA polymerase sigma factor  37.36 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00853605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3190  RNA polymerase sigma factor  37.36 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1921  RNA polymerase sigma factor  38.14 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2266  RNA polymerase sigma factor  38.46 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2195  RNA polymerase sigma factor  36.26 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4100  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  28.57 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3909  sigma-24 (FecI-like)  26.05 
 
 
182 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5141  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.33 
 
 
196 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0696  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.06 
 
 
211 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000147428  decreased coverage  0.0000446652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3719  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  29.66 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0401  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.799117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0090  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.21 
 
 
212 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000230493  normal  0.0688251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3669  sigma-70 region 2  26.05 
 
 
182 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5835  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.21 
 
 
234 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4931  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.92 
 
 
216 aa  50.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6530  RNA polymerase ECF-type sigma factor  28.81 
 
 
182 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1787  RNA polymerase sigma factor  24.44 
 
 
223 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6588  sigma-24 (FecI-like)  26.26 
 
 
203 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0137066  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4228  sigma-24 (FecI-like)  25.64 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4535  RNA polymerase sigma factor SigK  25.61 
 
 
200 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3432  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  24.24 
 
 
220 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3919  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.76 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0250534  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2486  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.82 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00554  DNA-directed RNA polymerase subunit sigma  23.89 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.72 
 
 
200 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0098  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  28.38 
 
 
225 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0185132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2137  sigma-24 (FecI-like)  23.76 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2956  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.9 
 
 
190 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.465971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1825  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  19.4 
 
 
182 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0355081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3071  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.78 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0545  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  0.0924037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1027  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  19.71 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3587  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.16 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.866365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0235  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  22.89 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4371  RNA polymerase sigma factor SigK  24.36 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4458  RNA polymerase sigma factor SigK  24.36 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.13066  normal  0.0588281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1084  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.57 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4752  RNA polymerase sigma factor SigK  24.36 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.399103  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1467  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000401501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2945  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.69 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0616617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1694  RNA polymerase sigma factor  27.42 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0489  RNA polymerase sigma factor  23.93 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1836  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.44 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1234  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.67 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.541877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4650  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.56 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0257  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0811664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1454  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0283325  normal  0.466266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0297  RNA polymerase sigma factor  27.47 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0762  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.63 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2286  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.86 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3502  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.89 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000695897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0342  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.95 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5901  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.6 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3727  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.89 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1678  sigma-24 (FecI-like)  22.73 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2178  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.73 
 
 
196 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10450  RNA polymerase sigma factor SigK  25 
 
 
187 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2267  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.73 
 
 
196 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0916495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5290  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.48 
 
 
194 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1907  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.73 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4224  RNA polymerase sigma-24 factor  20.45 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3120  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.8 
 
 
256 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0379225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  27.69 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2126  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.27 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  0.031897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3490  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  17.69 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.269956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4207  RNA polymerase sigma factor SigK  22.83 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3677  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.23 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3290  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.37 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0289  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6256  RNA polymerase sigma factor  24.18 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01782  RNA polymerase sigma factor  24.79 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1098  sigma-24 (FecI-like)  26.92 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2659  RNA polymerase sigma factor  22.63 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2251  RNA polymerase sigma-70 factor  33.33 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1062  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.96 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3547  putative RNA polymerase sigma-e factor sigma-24  29.69 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.257444  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0890  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.23 
 
 
220 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4204  sigma-70 region 2 domain-containing protein  22.41 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0709  RNA polymerase sigma factor  21.54 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2957  putative RNA polymerase sigma factor  25.42 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3433  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.87 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  21.21 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2563  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.16 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25487  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4014  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.05 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.637495  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1268  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00112474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4772  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.32 
 
 
182 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>