More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6805 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  40.83 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  39.58 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 287 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.86 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  38.21 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  37.42 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  37.38 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  37.38 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  38.87 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  37.23 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  37.32 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.06 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 290 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  36.23 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  34.4 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>