74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5737 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  50.95 
 
 
221 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  51.43 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  44.29 
 
 
216 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  48.83 
 
 
211 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  47.14 
 
 
229 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  41.9 
 
 
216 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  39.07 
 
 
255 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  42.86 
 
 
309 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  39.29 
 
 
221 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  37.5 
 
 
268 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  40.65 
 
 
241 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  40.65 
 
 
255 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  35.22 
 
 
393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  34.78 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  32.08 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  34.58 
 
 
220 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  32.14 
 
 
325 aa  97.8  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  31.02 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  30.57 
 
 
393 aa  95.9  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  28.64 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  36.15 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  31.92 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  31.05 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.86 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  27.44 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.57 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  33.48 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  24.68 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  25.11 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  27.06 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  30.6 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  26.34 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  35.45 
 
 
304 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  35.04 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  29.81 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  34.62 
 
 
285 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  30.77 
 
 
338 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  31.73 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  30.56 
 
 
332 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  33.02 
 
 
430 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  33.96 
 
 
191 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3066  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
427 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000595746  normal  0.0576025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  32.08 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  34.33 
 
 
364 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  27.5 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  32.41 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  45.45 
 
 
2159 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  32.41 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  33.01 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  31.75 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0628  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  34.55 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1181  acetyltransferase or hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.07 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.899858  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  34.07 
 
 
1878 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  27.03 
 
 
1381 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  26.82 
 
 
360 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  26.82 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  26.82 
 
 
360 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  25.85 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  34.58 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  26.82 
 
 
364 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  33.08 
 
 
364 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  33.96 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
568 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  24.77 
 
 
276 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  31.87 
 
 
683 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  32.33 
 
 
364 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  33.58 
 
 
364 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  33.58 
 
 
364 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  30.17 
 
 
332 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>