More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2306 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 		 395 aa  793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  36.86 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  34.7 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  32.69 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 332 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  31.68 
 
 		 329 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4895  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.259797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.7 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1252  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385086 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 327 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 337 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6267  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0737  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.06 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.23 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2026  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 341 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  37.5 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 343 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  37.74 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  30.48 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  30 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2316  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  28.75 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  26.88 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  38 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  39.18 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>