More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7280 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 166 aa  343  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  51.08 
 
 		 203 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  43.26 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.74 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03961  conserved hypothetical protein  40.56 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5989  normal  0.49745 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  36.43 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 199 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  41.13 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 215 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.41 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  41.73 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 215 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  39.72 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.93 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  34.42 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  37.97 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  35.25 
 
 		 287 aa  104  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  39.37 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  39.37 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.1 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  38.22 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.39 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 200 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  36.94 
 
 		 219 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  34.42 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  33.12 
 
 		 226 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 206 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  38.97 
 
 		 200 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 209 aa  98.2  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 210 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.3 
 
 		 205 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.1 
 
 		 291 aa  97.4  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 231 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.11 
 
 		 219 aa  95.5  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 200 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 206 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 216 aa  95.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 197 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0551  major surface protein  34.78 
 
 		 186 aa  94.4  7e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 200 aa  94  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 217 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 205 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 217 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  30.99 
 
 		 297 aa  92.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 198 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 205 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 226 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 211 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 205 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  34.93 
 
 		 206 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  36.3 
 
 		 199 aa  90.9  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 213 aa  90.9  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 202 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  39.55 
 
 		 205 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 196 aa  90.5  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2847  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 203 aa  90.5  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>