262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7277 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  81.14 
 
 		 228 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  81.37 
 
 		 231 aa  339  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  64 
 
 		 231 aa  288  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  67 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  64.85 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  64.62 
 
 		 232 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  59.38 
 
 		 241 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  80.42 
 
 		 149 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  56.15 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  48.88 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  56.42 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  54.3 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  52.88 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  52.88 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  54.05 
 
 		 197 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  39.66 
 
 		 385 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  41.24 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  38.14 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  36.7 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 		 432 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.04 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.32 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  35.93 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  34.32 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 358 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.58 
 
 		 389 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  37.72 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.9 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  36.87 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 197 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.46 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  34.73 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  31.71 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  37.13 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  34.12 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  34.76 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  34.94 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  35.88 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  34.1 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.34 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  32.1 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  36.53 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  30.59 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.1 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  30.59 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  32.97 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  34.39 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  31.93 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  28.72 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  28.88 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.33 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  30.23 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  28.44 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  30.23 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  28.42 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  28.82 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.34 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  27.89 
 
 		 340 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  27.89 
 
 		 345 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 340 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 345 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 345 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.14 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  27.89 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3056  putative transcriptional regulator  56.25 
 
 		 99 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.132705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.99 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  26.84 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  29.84 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.91 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  31.25 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.34 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  31.18 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  31.18 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>