269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4197 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  83.63 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  79.57 
 
 		 245 aa  349  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  65.88 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  64.85 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  64.85 
 
 		 241 aa  264  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  63.37 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  61.54 
 
 		 231 aa  258  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  51.4 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  56.22 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  52.11 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  52.22 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.44 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.44 
 
 		 205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  51.63 
 
 		 197 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  59.84 
 
 		 149 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  32.98 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  32.49 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  33.16 
 
 		 385 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 456 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 455 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  32.62 
 
 		 458 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  36.93 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  32.16 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  31.75 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.63 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  32.31 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  31.72 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.69 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  31.28 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  30.67 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  32 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  30.9 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  32.99 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  31.35 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.93 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  32.34 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  32.28 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.09 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.22 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  32.34 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  29.69 
 
 		 432 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  32.96 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  34.41 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.64 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  30.86 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  34.72 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  35.15 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.51 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  35.33 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.99 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  29.78 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  31.33 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.78 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  31.95 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  31.95 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.54 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  31.95 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  29.05 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  31.95 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  31.79 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  29.94 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.82 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  31.79 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.75 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.67 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  34.73 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.18 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  29.05 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.77 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>