264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4583 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  66.38 
 
 		 241 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  63.51 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  65.88 
 
 		 229 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  62.33 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  64.62 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  64.55 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  63.68 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  59.09 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.68 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  56.22 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.21 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.21 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  52.69 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  50 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  60.63 
 
 		 149 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  37.86 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  37.1 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  35.6 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  37.69 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  38.32 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  38.32 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  32.69 
 
 		 385 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  32.52 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  35.67 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.56 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  33.85 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  35 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  32.79 
 
 		 432 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.14 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  35.56 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.29 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.29 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  33.64 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.24 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  34.83 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  32.93 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.92 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  31.18 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  36.22 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.74 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.55 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.15 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.54 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  33.74 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.63 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.67 
 
 		 534 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  32.32 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  31.1 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  32.5 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  31.96 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  29.17 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  31.87 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  30.69 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  32.5 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  29.44 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  31.32 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.18 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  32.4 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  28.7 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  32.63 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  27.75 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  30 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  33.58 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  32.93 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  29.63 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.56 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  30.72 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  28.16 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  32.56 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  28.31 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>