More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7089 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7089  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5243  ABC transporter ATP-binding protein  51.74 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4888  ABC transporter related  51.53 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4799  ABC transporter related  51.53 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5537  ABC transporter related  50.87 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0407742  hitchhiker  0.00000719061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7436  ABC transporter  52.99 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  45.11 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  45.88 
 
 		 549 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  45.38 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  40.76 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.49 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  43.61 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  41.81 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.23 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.98 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.1 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 233 aa  174  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  39.91 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 241 aa  174  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  41.1 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.41 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  41.45 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  43.29 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5600  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2791  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889429  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.43 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  41.53 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  41.28 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  38.05 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.68 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  40.34 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  40 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.31 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  39.83 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  41.45 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  43.23 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  40.08 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  41.05 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  43.23 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  41.05 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  39.32 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.13 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  42.24 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.06 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.52 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.52 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  38.46 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2110  ABC transporter related  41.77 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  39.83 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  41.05 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.52 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  41.98 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  40.85 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  40.85 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  40.77 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  40.83 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  40.77 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.01 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  39.66 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.03 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  44.49 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  42.5 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  40.17 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  44.2 
 
 		 823 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>