259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4491 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4401  ribose 5-phosphate isomerase  87.29 
 
 		 236 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1014  ribose-5-phosphate isomerase A  72.88 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000356183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  73.73 
 
 		 237 aa  358  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4323  ribose-5-phosphate isomerase A  72.88 
 
 		 237 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000328743  normal  0.0305094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4263  ribose-5-phosphate isomerase A  72.88 
 
 		 237 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4885  ribose-5-phosphate isomerase A  72.46 
 
 		 237 aa  347  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0584  ribose-5-phosphate isomerase A  68.4 
 
 		 241 aa  320  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000147194  hitchhiker  0.00885466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2071  ribose-5-phosphate isomerase A  59.23 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0601  ribose-5-phosphate isomerase A  57.08 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  56.9 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04321  ribose-5-phosphate isomerase A  57.08 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  55.96 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16691  ribose-5-phosphate isomerase A  55.36 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  55.5 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16931  ribose-5-phosphate isomerase A  54.46 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1582  ribose-5-phosphate isomerase A  53.78 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16801  ribose-5-phosphate isomerase A  54.02 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0458  ribose 5-phosphate isomerase  52.73 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0355  ribose-5-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3172  ribose-5-phosphate isomerase A  54.13 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000119235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0401  ribose-5-phosphate isomerase A  53.67 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.603684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0436  ribose-5-phosphate isomerase A  53.67 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1484  ribose-5-phosphate isomerase A  52.75 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0505  ribose-5-phosphate isomerase A  50.46 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3758  ribose 5-phosphate isomerase  51.75 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1945  ribose 5-phosphate isomerase  50.68 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0737  ribose-5-phosphate isomerase A  47.32 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0773  ribose-5-phosphate isomerase A  47.14 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0918  ribose 5-phosphate isomerase  49.75 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000360061  hitchhiker  0.000000000600867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1386  ribose 5-phosphate isomerase  47.71 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0832  ribose 5-phosphate isomerase  48.4 
 
 		 228 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0583  ribose 5-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0131206  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  44.89 
 
 		 287 aa  185  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2632  ribose-5-phosphate isomerase A  48.66 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0364  ribose-5-phosphate isomerase A  50.8 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.972448  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.87 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1641  ribose-5-phosphate isomerase A  44.83 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  41.59 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  43.66 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0569  ribose 5-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0123  ribose-5-phosphate isomerase A  46.33 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1135  ribose-5-phosphate isomerase A  50.48 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0350264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1457  ribose 5-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  43.64 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  43.18 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  40.08 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0742  ribose 5-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0862335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  43.19 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  41.36 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  40.38 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  41.33 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0647  ribose-5-phosphate isomerase A  46.51 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.807989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  39.92 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  38.81 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  39.45 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  43.93 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  38.27 
 
 		 250 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0355  ribose-5-phosphate isomerase A  46.54 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.991442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  42.72 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  41.55 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  41.4 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  43.11 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  41.18 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  38.32 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  37.45 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0187  ribose 5-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0086  ribose-5-phosphate isomerase A  42.99 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  39.55 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0842  ribose-5-phosphate isomerase A  41.96 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  44.19 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  41.28 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  37.86 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  37.86 
 
 		 262 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3683  ribose-5-phosphate isomerase A  43.12 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  39.11 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0601  ribose 5-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>