More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3985 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.29 
 
 
7210 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 
3711 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  31.03 
 
 
1612 aa  668    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.59 
 
 
1602 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  41.45 
 
 
1827 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.16 
 
 
3494 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.73 
 
 
3493 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  42.54 
 
 
4268 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  45.91 
 
 
6889 aa  715    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.12 
 
 
2376 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.77 
 
 
2719 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.6 
 
 
2066 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 
5154 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.63 
 
 
3033 aa  670    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 
1577 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.4 
 
 
2316 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 
3089 aa  989    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 
1424 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
2551 aa  5262    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.97 
 
 
1874 aa  1232    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  56.69 
 
 
1656 aa  1060    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  44.13 
 
 
1144 aa  840    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  57.42 
 
 
1587 aa  1117    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 
1646 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.59 
 
 
3093 aa  1045    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  45.06 
 
 
2232 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.78 
 
 
2604 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 
7279 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 
1582 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  43.08 
 
 
3252 aa  770    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 
1574 aa  782    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 
4646 aa  1023    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 
1955 aa  695    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  43.91 
 
 
4151 aa  734    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  41.98 
 
 
3158 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 
2081 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  53.77 
 
 
1349 aa  1024    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.54 
 
 
4165 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  42.67 
 
 
2943 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  38.83 
 
 
3718 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 
2150 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.71 
 
 
3101 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  48.61 
 
 
3693 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.18 
 
 
1402 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 
1520 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
1208 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  31.3 
 
 
1580 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  47.83 
 
 
3099 aa  776    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 
1939 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  31.28 
 
 
1612 aa  669    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  47.27 
 
 
2551 aa  878    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  47.4 
 
 
1909 aa  825    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  53.5 
 
 
1354 aa  1054    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
3099 aa  1805    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  41.94 
 
 
2985 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  51.19 
 
 
3176 aa  917    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 
1559 aa  1180    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  52.19 
 
 
3645 aa  880    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  50.55 
 
 
4478 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  44.34 
 
 
2333 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 
1548 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 
2093 aa  676    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  48.61 
 
 
3693 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.26 
 
 
3508 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 
1520 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  49.45 
 
 
2462 aa  869    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  31.3 
 
 
1580 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
2374 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 
5255 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  49.11 
 
 
3676 aa  867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  48.13 
 
 
2477 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  50.61 
 
 
3696 aa  889    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.26 
 
 
4840 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  53.36 
 
 
1087 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  33.96 
 
 
1812 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 
1581 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
3130 aa  1286    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.51 
 
 
3463 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  32.85 
 
 
1535 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.05 
 
 
2024 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  40.49 
 
 
2126 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  41.43 
 
 
1584 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 
1789 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 
3254 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.02 
 
 
3090 aa  1003    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  55.53 
 
 
1337 aa  996    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  45.1 
 
 
2230 aa  777    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  48.61 
 
 
3702 aa  877    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
4111 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
2762 aa  1044    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 
1580 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 
2880 aa  815    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  31.76 
 
 
1537 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  32.84 
 
 
3108 aa  999    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 
1832 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  42.33 
 
 
2047 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  48.79 
 
 
3679 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.17 
 
 
2367 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  40.91 
 
 
1071 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  43.09 
 
 
2498 aa  655    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>