More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3444 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
334 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105526  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.9 
 
 
332 aa  574  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.26 
 
 
330 aa  346  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 
325 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.72 
 
 
334 aa  332  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.6 
 
 
340 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
342 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
324 aa  329  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
321 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
324 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.94 
 
 
322 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
368 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
323 aa  312  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.47 
 
 
327 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.65 
 
 
362 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.62 
 
 
327 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.4 
 
 
328 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
368 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.47 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.06 
 
 
362 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.22 
 
 
323 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
358 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.29 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.64 
 
 
373 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.48 
 
 
328 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.48 
 
 
360 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.42 
 
 
328 aa  298  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.42 
 
 
333 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.42 
 
 
363 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1005  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45 
 
 
348 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
343 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
343 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
339 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.21 
 
 
339 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.24 
 
 
351 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 
329 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.24 
 
 
351 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1630  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.83 
 
 
346 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1701  GDP-mannose 4,6 dehydratase  45.83 
 
 
346 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.53 
 
 
380 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.04 
 
 
368 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
346 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.27 
 
 
343 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.25 
 
 
361 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.87 
 
 
351 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  44.97 
 
 
355 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.49 
 
 
343 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.56 
 
 
347 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.06 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000104251 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.82 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.87 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6734  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.48 
 
 
344 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.98 
 
 
342 aa  285  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.35 
 
 
364 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.97 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.9 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.53 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.93 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.99 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  43.99 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
348 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.04 
 
 
363 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.3 
 
 
367 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.35 
 
 
348 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.6 
 
 
345 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.65 
 
 
346 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.37 
 
 
328 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
326 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.74 
 
 
340 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.4 
 
 
361 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.1 
 
 
360 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 
350 aa  279  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.08 
 
 
348 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.08 
 
 
348 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.08 
 
 
348 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0432  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.5 
 
 
382 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.64 
 
 
357 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  41.84 
 
 
342 aa  278  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.06 
 
 
346 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.23 
 
 
348 aa  278  8e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  44.83 
 
 
344 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 
363 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1158  GDP-mannose 4,6-dehydratase  43.36 
 
 
344 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00134514  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.35 
 
 
344 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.54 
 
 
319 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  46.27 
 
 
340 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0400  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.6 
 
 
372 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2945  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
329 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0880  GDP-mannose 4,6-dehydratase  42.6 
 
 
372 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>