More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3965 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  70.12 
 
 
505 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  100 
 
 
509 aa  1001    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  50.88 
 
 
536 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  50.75 
 
 
492 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  45.04 
 
 
484 aa  359  8e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  43.5 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  41.92 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  43.53 
 
 
508 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.73 
 
 
504 aa  279  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
513 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.22 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.07 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.4 
 
 
530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.46 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.93 
 
 
532 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.52 
 
 
522 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.72 
 
 
568 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.21 
 
 
553 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.88 
 
 
546 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.48 
 
 
560 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.54 
 
 
556 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.67 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
536 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.54 
 
 
557 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
548 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 
544 aa  144  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.2 
 
 
556 aa  144  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.8 
 
 
583 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.72 
 
 
550 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.94 
 
 
536 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.11 
 
 
542 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  29.08 
 
 
544 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 
542 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.86 
 
 
553 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.42 
 
 
501 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.24 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.8 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.1 
 
 
522 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.91 
 
 
569 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.6 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  28.88 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.73 
 
 
554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.81 
 
 
619 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.41 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.72 
 
 
539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.08 
 
 
547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.81 
 
 
522 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.35 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.14 
 
 
541 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.15 
 
 
522 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.15 
 
 
522 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.56 
 
 
522 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.48 
 
 
579 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 
540 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  31.32 
 
 
565 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 
548 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 
543 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
565 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.04 
 
 
525 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.15 
 
 
564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.88 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.64 
 
 
544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26 
 
 
552 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  27.79 
 
 
576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.34 
 
 
520 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.42 
 
 
522 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.02 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 
541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.56 
 
 
563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.33 
 
 
574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  32.66 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.17 
 
 
560 aa  117  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.51 
 
 
541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.45 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.27 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.91 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.3 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.79 
 
 
544 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  39.38 
 
 
532 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.14 
 
 
580 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
548 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
548 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
548 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.27 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.22 
 
 
568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.65 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
555 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.81 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.34 
 
 
537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.4 
 
 
542 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.3 
 
 
537 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.19 
 
 
538 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.68 
 
 
543 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 
589 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.51 
 
 
583 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.04 
 
 
537 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>