More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3116 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  95.44 
 
 
241 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  72.5 
 
 
241 aa  322  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  67.06 
 
 
265 aa  315  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  64.05 
 
 
262 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  60.74 
 
 
263 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  64.6 
 
 
297 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  58.33 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  57.5 
 
 
265 aa  272  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  59.2 
 
 
272 aa  268  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1233  ABC transporter related  60.24 
 
 
262 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 
273 aa  221  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.85 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  53.37 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  52.76 
 
 
261 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 
264 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.38 
 
 
280 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  50 
 
 
259 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  51.44 
 
 
278 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 
259 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.16 
 
 
253 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  45.49 
 
 
313 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 
259 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.19 
 
 
284 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.8 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.21 
 
 
265 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.85 
 
 
288 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.79 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.89 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.89 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.15 
 
 
273 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  41.54 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.44 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.64 
 
 
330 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.55 
 
 
263 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  50.72 
 
 
262 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.75 
 
 
263 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.41 
 
 
287 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.12 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.87 
 
 
297 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.55 
 
 
269 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
272 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  44.69 
 
 
274 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
256 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
272 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 
264 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.17 
 
 
246 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
311 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
253 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.5 
 
 
271 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 
271 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 
271 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54.92 
 
 
267 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
254 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.51 
 
 
284 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.02 
 
 
289 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  50.24 
 
 
261 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.51 
 
 
284 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.77 
 
 
246 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.12 
 
 
272 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.91 
 
 
274 aa  191  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.91 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  42.17 
 
 
271 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.26 
 
 
272 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.25 
 
 
324 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  43.59 
 
 
267 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  45.75 
 
 
239 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.29 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.54 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.81 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.76 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.01 
 
 
448 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.06 
 
 
272 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  44.54 
 
 
311 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.29 
 
 
254 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  41.43 
 
 
274 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  48.1 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.38 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.73 
 
 
251 aa  188  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.26 
 
 
264 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  46.41 
 
 
448 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.5 
 
 
259 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.75 
 
 
255 aa  187  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.33 
 
 
257 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.98 
 
 
274 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.5 
 
 
291 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
260 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
437 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.22 
 
 
260 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.63 
 
 
290 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  48.1 
 
 
444 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.23 
 
 
274 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  40.65 
 
 
268 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.7 
 
 
432 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>