More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1812 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.59 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  36.94 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  34.26 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  32 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.96 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.33 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  31.03 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4016  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  33.66 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.43 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.43 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 835 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  31.44 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.81 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.88 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.11 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.65 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.11 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.19 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.8 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  29.97 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.77 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3597  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.811202  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0701  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00289091  hitchhiker  0.0000121601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.38 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.68 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.06 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.63 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.63 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.13 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 339 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  33.45 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.55 
 
 		 311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  30.18 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.65 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  31.16 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  30.54 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>