More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0764 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  100 
 
 		 349 aa  689    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  79.25 
 
 		 360 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  79.3 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  79.42 
 
 		 376 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  58.69 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  58.4 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  57.78 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  57.96 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.87 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  53.13 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  29.3 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  28.16 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  27.81 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  27.81 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.23 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  26.71 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  27.76 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  28.93 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  25.8 
 
 		 337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  28.8 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  26.57 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  26.57 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  26.57 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2416  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  28.8 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  29.48 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  28.57 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  28.57 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2578  ABC transporter permease  26.23 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  29.67 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  28.88 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  31.98 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  26.44 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  29.28 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1136  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  28.25 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.33 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  29.33 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  27.61 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  28.62 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1661  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  29.34 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  29.34 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.04 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  27 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  26.93 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  27.67 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2316  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00754552  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  29.8 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  27.94 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  30.42 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  30.77 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  27.65 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>