More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0101 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  100 
 
 		 342 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  36.12 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  35.25 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.52 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  30.88 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 		 354 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0352  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.49 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.18 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.18 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4016  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  28.75 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  32.42 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  32.42 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  28 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  27.09 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4777  Monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  28.99 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  29.19 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  30.9 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  29.11 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.9 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  28.75 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  28.75 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  28.76 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  28.72 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  27.22 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  28.87 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  31.27 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  28.01 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  28.48 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  27.46 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.8 
 
 		 400 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  28.66 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  28.66 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  28.8 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 835 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.2 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  26.19 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>