More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0352 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0352  inner-membrane translocator  100 
 
 		 337 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0318  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30.82 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.82 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  32.33 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.82 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 311 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.82 
 
 		 311 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 		 311 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  29.67 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  31.71 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.34 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  28.43 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.11 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  31.51 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  29.77 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  28.4 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.15 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  29.15 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  29.68 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.03 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  29.71 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  29.68 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  29.68 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  29.68 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  29.71 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  28.19 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  28.19 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  29.65 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.58 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  32.93 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 381 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  30.55 
 
 		 381 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  29.01 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  28.85 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>