More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0318 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0318  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0352  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  35.8 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  33.9 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.69 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 835 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.89 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  30.9 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  30.9 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.69 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.73 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  28.86 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  29.74 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.85 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.85 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  33.03 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.85 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0883  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.85 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.04 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.1 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.21 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.5 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2584  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  31.74 
 
 		 351 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.34 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  27.88 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  30.25 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  34.42 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  34.42 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.25 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>